样品质检-项目确认-芯片实验-数据分析

　　二、样品要求

　　1． DNA 浓度大于50ng/ul。

　　2． DNA 样品体积大于20ul。

　　3． DNA 总量大于1ug。

　　4． DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之间，琼脂糖电泳检测DNA主带清晰完整，无明显RNA污染及蛋白质大分子污染。

　　5． 请附送一管DNA样品的溶解介质。

　　6． 请务必保证样品运送过程中温度保持在4度以下，夏季以干冰运送为好。

　　三、芯片的特点

　　1.密度高信息量大

　　BeadArray芯片密度高，9平方毫米的面积上有5万个不同类型的微珠，一张芯片*多可容纳300k特异性标记的微珠。

　　2.需要样本量少，成本低

　　illumina芯片面积小意味着需要的标记样品量少，反应所需样品量仅为250ng；全基因组分型芯片仅为750ngDNA。

　　3.重复性好

　　由于标记的微珠混合均匀，且是自行组装的，不存在点样误差，每张芯片在解码时都通过杂交进行质量控制，illumina对不同304,556个SNP进行了对照实验，结果显示304,511个SNP无差异，重复性达到了99.99%。

　　4.实验成功率高

　　BeadArray技术是利用编码序列间接杂交的。
所有的编码序列都经过特殊设计，具有近似的杂交温度，退火温度以及CG含量稳定等特点，杂交效率很高。
所以，使用微珠芯片进行基因分型实验的成功率极高。
对2,267,188个SNP进行分型，其中只有1,432个基因型未被检出，实验成功率达到了99.94%。

　　5.准确性好

　　对BeadArray芯片得到的1,940,990个SNP结果进行分析，从中只发现发了97个SNP有孟德尔遗传错误和578个基因重组错误。
其孟德尔遗传错误率只有0.0049%，基因重组率错误只有0.029%。

　　6.芯片格式灵活多样

　　客户可根据样本量以及SNP位点数量来确定使用何种格式的芯片。

　　治具结构类型

　　1.翻盖式

　　适用的产品类型：尺寸小的PCB板，如手机、数码相机、MP3/MP4等产品。

　　适用的芯片类型：封装尺寸20*20mm以下，球数在300pin内的产品。

　　2.夹手式

　　适用的产品类型：尺寸中等和外接端口较多的PCB板，如网络路邮器、数码相机、MP3/MP4等产品。

　　适用的芯片类型：封装尺寸30*30mm以下，球数在300pin内的产品。

　　3.旋压式

　　适用的产品类型：PCB板尺寸和芯片尺寸较大的产品，如电脑主板，游戏机，打印机等产品。

　　适用的芯片类型：封装尺寸30*30mm以上，球数在500pin以上的产品。

　　治具连接方式

　　1.pogo pin连接

　　优点：维修时主板拆换方便快捷，探针长度较短，的减少针间信号的串扰，可用作高频信号点的测试。

　　缺点：成本较高，针头弹力、刺穿能力较弱，针盘结构在待测的主板尺寸太大时需有定位孔、紧固螺丝孔。

　　2.转接针焊接型

　　优点：成本较低，特别适合大尺寸且没有紧固螺丝孔、定位孔的PCB板和点数较多、尺寸较大的芯片。

　　缺点：维修时交换主板需要专用返修工具，转接针盘循环焊接*多2-3次即要报废更新。